魔晶猎人第2季动画故事发生在世界中世纪，一种被称为魔晶的神奇能源被发掘。那里的宠物被称为龙兽，拥有魔晶就可以收服它们。外号扣子的主人公千瑞，是月亮镇的小裁缝，除了会修理战甲外，只是一个普通的少年。直到有一天，奇奇怪怪的朋友们一一出现在他的面前，千瑞心中的魔晶猎人梦被点燃了！为了寻找神秘失踪的父亲，系上代表着母亲思念和心灵家园的扣子，千瑞踏上旅程，开始了魔晶猎人学院的修炼之旅。结果会如何呢？