随着宇宙负能量不断的扩散与增大，M78星云?光之国的宇宙警备队不得不加强了戒备。就在这时，一位邪恶的战士从宇宙监狱的封印中被解放出来，发誓要复仇，并对光之国进行袭击。他夺取了奥特曼战士的生命之源：人工太阳等离子火花的核心，和被禁用的吉咖战斗仪“千兆战斗仪”，企图复活并控制怪兽牧场里的100头怪兽和宇宙人，这就是光之国的“负之记忆”——贝利亚奥特曼。要阻止已经得到雷奥尼克斯之力的贝利亚，就需要和他拥有相同雷奥尼克斯力量的地球人——雷的帮助。梦比优斯奥特曼为寻求帮助，带雷来到了光之国。此时，在远离光之国的K76星上，雷欧奥特曼正在为一位年轻的战士进行严格的特训……