升上高中之后就开始独自生活的主人公夏目智春。他在3年前被自称为守护灵的美少女水无神操绪附身。智春搬到了兄长夏目直贵曾经生活过的住宅鸣樱宅的那天，那里来了两个美女。当中一个黑衣美女名为黑崎朱理，来樱宅邸的原因是受直贵所托送上银色的手提箱，而另一个巫女装束的美女名为嵩月奏，她是为抢夺手提箱而来的。以得到此手提箱为契机，智春得知了世界隐藏的真实－－神舍弃了人类，这个世界曾遭一次毁灭，借助恶魔之力再生为第二度世界 。