故事发生在室町时代后期，当时腐败的日本幕府统治的日本，本来就民不聊生。却偏偏的在这个时候还碰上了百年不遇的灾害，京都一片荒野。漫画的主角阿修罗就是在这种极度饥荒的背景下出生的少年，本该走上邪路的他却遇见了一个少女并且即将扭曲的灵魂也被她救赎了。自此走上了出家修行的道路成为了一代高僧。