《健康智多星》故事讲述明朝年间，有位学者李时珍。他心地善良、悬壶济世，深受当地百姓爱戴。李时珍座下有一个小药童名叫阿吉。阿吉年约十岁，聪明伶俐，情操高尚，是个受人喜欢的小姑娘。 某日，阿吉跟随李时珍进山采药时看到一株从没见过的植物，生长在路边一个狭窄的石缝中。阿吉进入石缝中采药时失足跌落深渊并误入时空隧道...........